Title:
GRAPH THEORY IN SYSTEMS BIOLOGY
Date: November-2014

Team B2-2014: Efthymios-Orestis Koulaxidis
Student, Dept of Mechanical Eng, NTUA

Short Abstract:
Understanding complex systems, as systems biology, often requires a bottom-up analysis. We need to investigate those systems, not only as individual components but as a whole. This can be done by examining the elementary components individually and then how these are connected. These networks can be represented as graphs.


Introduction:
Η θεωρία των πολύπλοκων συστημάτων παίζει σημαντικό ρόλο σε πολλά επιστημονικά πεδία, όπως στην επιστήμη των υπολογιστών, στην κοινωνιολογία, τη μηχανική (engineering), τη φυσική, τη μοριακή και την πληθυσμιακή βιολογία. Στη Βιολογία και της Ιατρική, η ανάλυση μέσω δικτύων (και γράφων) έχει προοπτικές εφαρμογής σε πεδία όπως: τον καθορισμό του στόχου ενός νέου φαρμάκου, τον προσδιορισμό λειτουργίας πρωτεϊνών ή γονιδίων, το σχεδιασμό αποτελεσματικών στρατηγικών για τη θεραπεία διάφορων ασθενειών ή την έγκαιρη διάγνωση διαταραχών. Τα δίκτυα αλληλεπίδρασης μεταξύ πρωτεϊνών, τα βιοχημικά και μεταβολικά δίκτυα, τα δίκτυα μεταγραφικής ρύθμισης και τα δίκτυα μεταγωγής σήματος είναι οι κύριες κατηγορίες δικτύων στα βιολογικά συστήματα και συχνά έχουν παρόμοια χαρακτηριστικά και ιδιότητες.